Xã Hoà Mỹ được thành lập lần đầu tiên ngày 25 tháng 7 năm 1979, theo Quyết định 275-CP[4] của Hội đồng Chính phủ về việc điều chỉnh địa giới một số xã của huyện Cái Nước thuộc tỉnh Minh Hải. Theo đó, xã Hưng Mỹ được tách thành ba xã lấy tên là xã Hưng Mỹ, xã Hòa Mỹ và xã Bình Mỹ. Tuy nhiên, đến ngày 14 tháng 2 năm 1987, Quyết định 33B-HĐBT[5] của Hội đồng Bộ trưởng về việc phân vạch, điều chỉnh địa giới hành chính một số xã, thị trấn của huyện Cái Nước, tỉnh Minh Hải, đã sáp nhập xã Hòa Mỹ vào lại xã Hưng Mỹ.

Ngày 23 tháng 11 năm 2004, Chính phủ ra Nghị định 192/2004/NĐ-CP[6], tái lập xã Hòa Mỹ thuộc huyện Cái Nước trên cơ sở 3.860,20 ha diện tích tự nhiên và 9.326 nhân khẩu tách ra từ xã Hưng Mỹ, thuộc huyện Cái Nước, tỉnh Cà Mau.